Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp3P58854 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms