Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm2P58774 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms