Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gp1bbP56400 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms