Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Lbx1P52955 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Lbx1P52955 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Lbx1P52955 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lbx1P52955 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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