Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt6aP50446 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Krt6aP50446 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt6aP50446 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt6aP50446 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt6aP50446 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt6aP50446 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt6aP50446 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt6aP50446 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Krt6aP50446 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Krt6aP50446 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Krt6aP50446 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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