Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Tmod1P49813 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmod1P49813 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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