Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Psen1P49769 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psen1P49769 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms