Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtpreP49446 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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