Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf1P46099 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms