Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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