Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lig1P37913 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms