Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddit3P35639 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms