Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab20P35295 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab20P35295 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab20P35295 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms