Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn11P35235 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn11P35235 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms