Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp4P35123 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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