Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pola2P33611 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pola2P33611 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms