Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nedd1P33215 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms