Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms