Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrgP28705 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms