Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxd10P28359 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Hoxd10P28359 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxd10P28359 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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