Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjc1P28229 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjc1P28229 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms