Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChgaP26339 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms