Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnna1P26231 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms