Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms