Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a2P20490 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms