Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P20040 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P20040 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P20040 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P20040 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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