Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps6ka1P18653 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka1P18653 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms