Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hoxb1P17919 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Hoxb1P17919 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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