Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ass1P16460 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms