Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irf1P15314 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Irf1P15314 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Irf1P15314 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Irf1P15314 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Irf1P15314 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf1P15314 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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