Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calb1P12658 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms