Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DmdP11531 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DmdP11531 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DmdP11531 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DmdP11531 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DmdP11531 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DmdP11531 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DmdP11531 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DmdP11531 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DmdP11531 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DmdP11531 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DmdP11531 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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DmdP11531 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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DmdP11531 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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DmdP11531 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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DmdP11531 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DmdP11531 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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DmdP11531 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DmdP11531 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DmdP11531 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DmdP11531 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DmdP11531 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DmdP11531 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DmdP11531 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
DmdP11531 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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