Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms