Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PolP11369 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolP11369 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolP11369 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolP11369 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolP11369 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolP11369 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolP11369 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PolP11369 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PolP11369 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PolP11369 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PolP11369 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms