Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tmem254aP0DN89 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms