Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NclP09405 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NclP09405 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NclP09405 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NclP09405 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NclP09405 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NclP09405 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NclP09405 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NclP09405 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NclP09405 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NclP09405 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NclP09405 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NclP09405 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NclP09405 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms