Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxa5P09021 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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