Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnfP06804 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnfP06804 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnfP06804 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnfP06804 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms