Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd4P06332 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd4P06332 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd4P06332 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd4P06332 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd4P06332 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd4P06332 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd4P06332 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd4P06332 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd4P06332 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd4P06332 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd4P06332 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd4P06332 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd4P06332 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd4P06332 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd4P06332 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms