Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01878 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01878 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01878 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01878 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01878 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms