Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hcn3O88705 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms