Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BlmO88700 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BlmO88700 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BlmO88700 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BlmO88700 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BlmO88700 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BlmO88700 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BlmO88700 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BlmO88700 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms