Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shoc2O88520 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shoc2O88520 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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