Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan6O70401 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms