Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb5O70309 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itgb5O70309 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms