Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja1O55176 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja1O55176 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja1O55176 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pja1O55176 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pja1O55176 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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