Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnk2O54967 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms