Protein–RNA interactions for Protein: O54828

Rgs9, Regulator of G-protein signaling 9, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgs9O54828 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rgs9O54828 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rgs9O54828 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rgs9O54828 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rgs9O54828 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rgs9O54828 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rgs9O54828 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rgs9O54828 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms