Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnnd2O35927 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnnd2O35927 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnnd2O35927 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctnnd2O35927 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnnd2O35927 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnnd2O35927 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnnd2O35927 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnnd2O35927 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnnd2O35927 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnnd2O35927 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ctnnd2O35927 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnnd2O35927 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms