Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bnc1O35914 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bnc1O35914 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms